目前认为位于肝脏表面的囊肿如果直径超过5个cm，或者出现了囊内出血，合并感染，或者出现了压迫胃十二指肠症状，影响进食，均应当考虑手术处理。上述的手术指征只是针对先天性的肝囊肿，而对于寄生虫性肝囊肿，原则上一旦发现均应当进行手术，需要清除内囊，消灭外囊残腔，以防止囊肿过度增大，处理困难，另外如果出现囊肿破裂，还会造成过敏性休克，引起死亡。