。肥厚性心肌病，对于药物治疗无效，心功能不全（NYHA分级III-IV级）的患者，如果存在严重的流出道梗阻，即静息或运动时流出道压力阶差大于50mmHg，需要考虑行室间隔切除术。目前，美国和欧洲共识已经将手术列入合适患者的首选治疗。也可以经冠状动脉间隔支注入无水酒精，造成该供血区域心室间隔坏死，但是此种办法长期预后尚不清楚。