肾囊肿有结石是否严重，与囊肿的大小，结石的多少有关。如果是很小的肾囊肿，有比较小的肾结石，这种情况不严重，不用做特殊处理。囊肿直径小于5cm，都不需要进行特殊治疗，用药物治疗无效。囊肿大于5cm，可以考虑腹腔镜肾囊肿去顶减压手术。如果结石直径小于0.6cm以下，大多数都可以用药物进行排石治疗。结石大于0.6cm，小于2.0cm，可以行体外震波碎石；大于2.0cm的结石，可以采用经皮肾镜手术。同时有大的肾囊肿，多发性的结石，可以同时行经皮肾镜碎石，经皮肾囊肿穿刺处理。目前处理肾结石、肾囊肿方法很多，患者无需紧张，建议在医生指导下选择治疗方法。