脑梗死后呼吸困难的原因主要有以下几个方面。首先，大面积脑梗死病情危重，尤其是脑干梗死，容易影响到人体呼吸中枢，导致患者出现呼吸困难。其次，脑梗死后患者脑组织出现压迫，进而引起意识障碍和长期卧床，不能有效地进行吞咽和排痰，容易导致患者出现坠积性肺炎等疾病，从而引起呼吸困难。第三，患者脑梗死后出现昏迷等意识障碍，导致全身肌肉松软无力，舌根后坠阻塞气道引起呼吸困难，但这种情况较为少见。